Действие происходит в наши дни, спустя полгода после гибели великого сыщика от рук его заклятого врага Мориарти. Ватсон возобновляет свою медицинскую карьеру в качестве главы клиники, занимающейся лечением редких заболеваний. Доктор переключает свое внимание с раскрытия преступлений на раскрытие медицинских тайн, используя те навыки расследования, которые приобрел во время работы и дружбы с Холмсом.